Oddelek za klasično filologijo na drugi stopnji študija izvaja pet programov: enopredmetni študijski program Antični in humanistični študiji, dvopredmetni študijski program Grški jezik, književnost in kultura, dvopredmetni pedagoški študijski program Grški jezik, književnost in kultura, dvopredmetni študijski program Latinski jezik, književnost in kultura in dvopredmetni pedagoški študijski program Latinski jezik, književnost in kultura.
Študijski program na drugi stopnji traja 2 leti (4 semestre) in obsega skupaj 60 (dvopredmetni) oz. 120 (enopredmetni) kreditnih točk.
